Từ khi thành lập đến nay, Đoàn đã chủ động phối hợp với chính quyền địa phương tiến hành khảo sát, quy hoạch, đầu tư xây dựng hệ thống cơ sở hạ tầng kinh tế - xã hội được 21 công trình gồm: Công trình điện, đường giao thông, công trình thủy lợi, công trình nước sinh hoạt, phòng học Mầm non, nhà văn hóa thôn, bản…; kết hợp tổ chức, bố trí lại 11 cụm điểm dân cư trên địa bàn, từng bước hình thành các thôn, bản, cụm điểm dân cư tập trung trên vành đai biên giới, địa bàn xung yếu, tạo hành lang bảo vệ chủ quyền Quốc gia. Đồng thời, tích cực triển khai các chương trình khuyến nông, khuyến lâm, xóa đói giảm nghèo, hỗ trợ, tạo điều kiện giúp nhân dân phát triển sản xuất, ổn định cuộc sống, khắc phục tình trạng di cư, dịch cư tự do, tập quán du canh, du cư, tự cung, tự cấp… góp phần cùng cấp ủy, chính quyền địa phương giảm tỷ lệ hộ nghèo từ 75% (năm 2003) xuống còn 37,67% (năm 2020). Thu nhập bình quân đầu người vùng dự án khu kinh tế quốc phòng đạt 20,7 triệu đồng/người/năm.

Cùng với thực hiện mục tiêu phát triển kinh tế, tổ chức sản xuất, làm nòng cốt hỗ trợ nhân dân xóa đói giảm nghèo, Đoàn kinh tế - quốc phòng 5 còn đẩy mạnh công tác dân vận, tham gia xây dựng cơ sở chính trị, gắn phát triển kinh tế - xã hội với tăng cường quốc phòng, an ninh trên địa bàn. Bằng các hoạt động thiết thực, Đoàn đã làm tốt công tác tuyên truyền, vận động nhân dân thực hiện đường lối, chủ trương của Đảng, chính sách, pháp luật Nhà nước; tích cực đưa văn hóa, y tế về thôn, bản, góp phần xóa mù chữ, giải quyết những vấn đề bức xúc của công tác y tế ở vùng sâu, vùng xa, biên giới.

Đến nay, Khu kinh tế - quốc phòng Mường Lát đã và đang phát huy hiệu quả trên nhiều mặt, góp phần tạo nên diện mạo, thế và lực mới cả về chính trị, kinh tế - xã hội, quốc phòng, an ninh trên vùng đất biên cương của Tổ quốc.